concernant les flux rss de calibre, si tu règles ton format de sortie par défaut en mobipocket, il te crée pas directement des fichiers mobi ? ça me paraît étrange, sinon... éventuellement, tu pourrais demander cette fonctionnalité à kovid (développeur de calibre).
tu pourrais aussi jeter un coup d'oeil sur feedbooks, qui propose également l'aggrégation de flux rss, dispos au format de ton choix (dont mobipocket) :
http://www.feedbooks.com/news