Gracias, Doitsu.
Ya tenía instalado el plug in EpubCheck, y era donde veía los errores.
¿Eres el autor del plug in? Te felicito por ello

Ayuda tenerlo tan a mano.
He ido logrado solucinar esos errores que me salían. Lo único extraño es que Calibre no me abre el ePub para previsualizar.
¡Un saludo!