VOISIN,
Avec aussi peu de détails, c'est pas facile de t'aider!
1) Le problème que tu mentionnes est-il récent (nouvelle version de calibre par exemple)?
2) S'agit-il d'un pdf issu d'un ocr (= mauvaise reconnaissance de certains mots lors de l'opération)?
3) As-tu essayé d'éditer et de corriger le epub avec ebook-edit de calibre (identifier les mots fautifs et les corriger avec chercher/remplacer)?