[eFTy]

Here is a direct copy paste from one of the books:

prologue.xhtml:

  <p>Sfârşitul culesului vaniliei atrage întotdeauna o mulţime de vizitatori. Sunt negustorii, apoi reprezentanţii reginei, bineînţeles, care vin să stabilească preţurile, dar mai sunt şi cei care vin să vadă zburătorii. Copacul a fost ales, doborât şi aşezat în piaţa oraşului, iar preoţii de toate confesiunile şi-au spus rugăciunile asupra lui, l-au tămâiat şi l-au stropit cu sânge de pui. Funiile au fost încercate şi ultimele amănunte, adăugate la pelerinele cu pene şi bonete. Dorm prost zilele astea şi m-am trezit de dimineaţă înainte de răsărit, bântuită de cântecul îndrăzneţ, singuratic al unui caporal <sup><a href="../Text/footnotes.xhtml#note-1" id="note-1-loc">1</a></sup> , care exersa la flaut sus, pe platforma sa, aplecat sub greutatea cerului şi a vânturilor.</p>

footnotes.xhtml:

  <p class="fn"><a href="../Text/prologue.xhtml#note-1-loc" id="note-1">1</a> - Şef de echipă – în lb. sp. în orig. (n. tr.).</p>

style0001.css:

.fn {page-break-after:always}

If I remove the pagebreak, I get all the footnotes (starting with the linked one) jumbled into the pop-up.

P.S. The language is Romanian, in case anyone's curious.