Oh Mist,
habe es auch gerade mal mit nem *.doc probiert, scheinbar kennt Calibre das Format nicht. Sorry, war mir nicht bewusst.
Blöderweise wurde das Format aber auch vom MobiPocket Crewator nicht erkannt, obwohl es da die Auswahl "MS Word Dokument gibt".
Falls das bei dir auch nicht klappen sollte bliebe noch die Möglichkeit dein *. doc als *.txt zu speichern, das kann Calibre dann auf jeden Fall umwandeln.
Andere Möglichkeit wäre ein Ticket bei Calibre zu eröffnen damit jemand ein Plugin für DOCs schreibt, das kann aber evtl länger dauern