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Du solltest insbesondere darauf achten, das Gerät vor dem Abziehen des USB- Steckers vom Computer abzumelden. Es kann sonst passieren, dass noch Schreibvorgänge nicht abgeschlossen sind, was zu Fehlern im Dateisystem führen kann.
Ich hab noch nie davon gehört, dass ein gleichzeitiges Zugreifen auf das Gerät mittels Calibre und dem Windows Explorer zu Problemen führt. Du wirst zwar keinen aktuellen Metadatencache haben, und ich weiß nicht, ob Calibre die Dateien in der Geräteansicht sofort entdeckt oder erst beim nächsten Verbinden, aber solche Symptome dürften dadurch nicht auftreten.
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