Hola!
que problema tienes?, desde que formato tratas de convertir?. Yo utilizo openoffice para convertir los doc/rtf/odt a html y de ahí los convierto a lrf. A veces he tenido problemas con la longitud de los nombres de los ficheros o que estos incluyan carácteres raros, pero salvo eso todo perfecto ...
Si puedo servirte de ayuda no dudes en preguntar y explicarte mas profundamente
saludos.
p.d: uso ubuntu 7.10