Willst Du das eBook später denn ausschließlich für Kindle Geräte zur Verfügung stellen? Oder willst Du dann auch eine ePub Datei veröffentlichen/bereitstellen?
Ich habe auch die Erfahrung gemacht, dass es nicht immer vernünftig klappt, wenn man von einem PDF ausgehend eine eBook Datei erstellt. Das hat bei meinem Buch kein Converter hinbekommen :/
Ich bin dann einen ganz anderen Weg gegangen und hab das Buch komplett neu in InDesign gemacht, das ging ganz gut (wenn auch von vielen Leuten als Erstellungsmethode wüst beschimpft), auch dahingehend, dass ich Fußnoten und Verlinkungen im eBook habe.
Das kommt für Dich aber vermutlich nicht in Frage, oder?
Ansonsten habe ich bisher nur gehört, dass fast alle sehr zufrieden sind, wenn sie Word Dateien konvertieren (oder konvertieren lassen, wie z.B. bei Smashwords).
Kann ich selber aber nicht beurteilen, da ich nicht mit Word arbeite
