Könnte es sein, reymund, dass du die Datei nicht erst speicherst, sondern gleich - ohne passendes Programm - zu öffnen versuchst? Epub ist ein gepacktes Format, und dein Betriebssystem muss den Umgang damit erst lernen. Calibre kann sozusagen alles, aber wenn du mit Firefox im Netz unterwegs bist, gibt es auch eine kleine, feine Erweiterung für ePub-Dateien:
http://www.epubread.com/de/