Hört sich für mich so an, als ob du statt <p> gerne <br> möchtest. Also einen einfachen Zeilenumbruch statt eines neuen Absatzes.
In Sigil hast du ja links alle Segmente des ePubs aufgelistet. Öffne eines, dann kannst du rechts mehr oder weniger arbeiten wie in einem Textverarbeitungsprogramm.
Lösche den "Leerraum" vor dem ungewollten Absatz raus, so dass der erste Buchstabe des Absatzes direkt an den vorherigen anschließt.
Jetzt drückst du eben
nicht einfach die Enter-Taste, um einen neuen Absatz einzufügen, sondern drückst STRG und die Enter-Taste.
Damit wird statt eines neuen Absatzes "nur" der gewünschte Zeilenumbruch eingefügt. Das kannst du auch so häufig wiederholen, wie du möchtest. Du kannst so den Abstand auch besser kontrollieren.
Das müsste eigentlich helfen. Speichern nicht vergessen.
